La recerca de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron es coordina i gestiona des de la Direcció de Recerca de l'HUVH a través de la Fundació Institut de Recerca de l’Hospital Universitari Vall d’Hebron, aglutinant, d'una manera integradora, la gestió dels recursos humans, materials i econòmics. El seu objectiu és promoure la recerca biomèdica en les seves vessants bàsica, clínica i epidemiològica, la recerca en serveis sanitaris i la gestió sanitària; totes lligades a l'objectiu final de millorar la salut de la població.

La Direcció de Recerca aplega funcionalment els grups de recerca de l'Hospital Universitari Vall d’Hebron al voltant d'onze àrees de recerca biomèdica, vuit de les quals són àrees de recerca bàsica i clinicoassistencial:

• Oncologia i genètica
• Sistema endocrí, creixement i metabolisme i diabetis
• Malalties cardiovasculars, hemostàsia i hipertensió
• Neurociències, salut mental i envelliment
• Fisiopatologia digestiva i hepatologia
• Malalties infeccioses i sida
• Immunologia: malalties respiratòries, sistèmiques i genètiques
• Patologia i teràpia cel·lular i gènica

La resta d'àrees de recerca de funcionament més transversal fan referència a les especialitats següents:

• Recerca en epidemiologia, salut pública i serveis sanitaris
• Recerca en farmacologia
• Recerca de noves tecnologies i cirurgia experimental

La major part dels grups adscrits a les diferents àrees estan associats a equips i serveis de l'Hospital Universitari Vall d’Hebron, però també s'hi integren grups que pertanyen a centres que realitzen la seva activitat al voltant de l'Hospital Universitari Vall d’Hebron, com el Centre de Transfusió i Banc de Teixits (CTBT), l'Institut de Diagnòstic per la Imatge (IDI) o l'Institut Català de Farmacologia (ICF), la qual cosa permet reforçar la integració de la recerca bàsica, clínica, terapèutica i de salut pública com un tot, potenciant el concepte d’hospital com a centre de recerca.